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PCR 與RT—PCR的概念及原理
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)是一種用于放大擴(kuò)增特定的DNA片段的分子生物學(xué)技術(shù),它可看作是生物體外的特殊DNA復(fù)制,PCR的*大特點(diǎn)是能將微量的DNA大幅增加。PCR技術(shù)的基本原理類似于DNA的天然復(fù)制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補(bǔ)的寡核苷酸引物。
RT—PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)是將RNA的反轉(zhuǎn)錄(RT)和cDNA的聚合酶鏈?zhǔn)綌U(kuò)增(PCR)相結(jié)合的技術(shù)。
原理是提取組織或細(xì)胞中的總RNA或者mRNA,在反轉(zhuǎn)錄酶的作用下將RNA或者mRNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA,再以該cDNA**鏈為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,根據(jù)靶基因設(shè)計(jì)用于PCR擴(kuò)增的基因特異的上下游引物,基因特異的上游引物與cDNA*1鏈退火,在Taq DNA聚合酶作用下合成cDNA第2鏈。再以cDNA**鏈和第2鏈為模板,用基因特異的上下游引物PCR擴(kuò)增獲得大量的cDNA。
Real-time PCR(實(shí)時(shí)熒光定量PCR)也可以縮寫為RT—PCR,此外還有一個(gè)qPCR(Quantitative Rea-ltime-PCR ),有人可能將這三者搞混。
其實(shí)Rea-ltime-PCR和 qPCR(Quantitative Rea-ltime-PCR )都是指實(shí)時(shí)定量PCR,即在PCR進(jìn)行的同時(shí),對(duì)其過程進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè),可以對(duì)起始模板數(shù)量進(jìn)行**的分析。并且國際上的約定俗成的是:RT-PCR特指反轉(zhuǎn)錄PCR,而Real-time PCR一般縮寫為 qPCR(quantitative real-time PCR)。
RT-PCR的方法已經(jīng)廣泛應(yīng)用于RNA的構(gòu)造解析、cDNA的克隆及RNA水平上的表達(dá)解析等多種領(lǐng)域。